Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms