Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms