Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP133Q8WUM0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms