Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms