Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms