Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms