Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3BQ7Z3V4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3BQ7Z3V4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3BQ7Z3V4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3BQ7Z3V4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3BQ7Z3V4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3BQ7Z3V4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms