Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
XIRP1Q702N8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms