Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEND4Q6ZU67 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms