Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRBA2Q6ZNG9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA2Q6ZNG9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms