Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms