Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms