Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms