Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4GALNT3Q6L9W6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4GALNT3Q6L9W6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
B4GALNT3Q6L9W6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
B4GALNT3Q6L9W6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
B4GALNT3Q6L9W6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4GALNT3Q6L9W6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms