Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.232e-7■■□□□ 11.8
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NIPBLQ6KC79 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.292e-7■■□□□ 11.8
NIPBLQ6KC79 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-6■■□□□ 11.8
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NIPBLQ6KC79 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.276e-7■■□□□ 11.7
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NIPBLQ6KC79 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.437e-6■■□□□ 11.7
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NIPBLQ6KC79 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.87e-6■■□□□ 11.7
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NIPBLQ6KC79 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 11.7
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NIPBLQ6KC79 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 36.04□□□□□ -1.449e-20■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 HMGN2-209ENST00000493418 1496 ntTSL 24.72□□□□□ -1.659e-20■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.779e-20■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.073e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.693e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.683e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.363e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.043e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.043e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 CLTA-205ENST00000464497 1890 ntTSL 513.51□□□□□ -0.253e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.13e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.523e-9■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.193e-9■■□□□ 11.6
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NIPBLQ6KC79 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.324e-7■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 215.69■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 315.36■□□□□ 0.051e-6■■□□□ 11.6
NIPBLQ6KC79 RPL13A-208ENST00000477613 796 ntTSL 515.12■□□□□ 0.011e-12■■□□□ 11.6
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