Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms