Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms