Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms