Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms