Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CANT1-212ENST00000591811 466 ntTSL 219.38■□□□□ 0.699e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.689e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-215ENST00000592887 555 ntTSL 418.54■□□□□ 0.569e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-205ENST00000588075 881 ntTSL 218.46■□□□□ 0.559e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.339e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-209ENST00000591625 599 ntTSL 416.77■□□□□ 0.289e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SLC39A5-210ENST00000481103 926 ntTSL 216.71■□□□□ 0.279e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-214ENST00000592228 1546 ntTSL 516.29■□□□□ 0.29e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 ARHGEF40-203ENST00000554514 2928 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.159e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SLC39A5-206ENST00000436633 871 ntTSL 515.7■□□□□ 0.19e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 515.22■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.019e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-208ENST00000590370 614 ntTSL 215□□□□□ -0.019e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-207ENST00000588611 900 ntTSL 313.09□□□□□ -0.319e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-201ENST00000302345 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.399e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.639e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.639e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SLC35E2B-201ENST00000480991 2860 ntTSL 214.52□□□□□ -0.091e-8■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 ATF6B-216ENST00000494022 320 ntTSL 213.86□□□□□ -0.193e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.558e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 SLC13A5-209ENST00000574580 5398 nt8.92□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.784e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 COASY-214ENST00000591779 994 ntTSL 217.34■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 COASY-205ENST00000586771 742 ntTSL 316.22■□□□□ 0.195e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 COASY-206ENST00000587157 551 ntTSL 412.14□□□□□ -0.475e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 FLOT2-209ENST00000584569 266 ntTSL 316.3■□□□□ 0.29e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.684e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 ACTN4-205ENST00000477174 544 ntTSL 314.94□□□□□ -0.026e-23■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 319.25■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 SEPT9-224ENST00000589246 594 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 20.7
PCBP1Q15365 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.263e-9■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-9■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.373e-9■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.53e-9■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 511.8□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.533e-9■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.666e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.446e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 MFGE8-214ENST00000560937 801 ntTSL 219.92■□□□□ 0.782e-11■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 C2-216ENST00000494905 536 ntTSL 414.73□□□□□ -0.053e-26■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 220.11■□□□□ 0.811e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.491e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 FHL3-202ENST00000475084 882 ntTSL 520.78■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 FHL3-205ENST00000485803 1468 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.93e-14■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.563e-14■■■■□ 20.6
PCBP1Q15365 GPX3-203ENST00000519214 834 ntTSL 515.76■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 GPX3-207ENST00000521650 467 ntTSL 214.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.258e-7■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 LSM2-212ENST00000477182 767 ntTSL 312.52□□□□□ -0.418e-7■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 PPP1R18-204ENST00000488324 1328 ntTSL 315.65■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 PPP1R18-203ENST00000467662 1156 ntTSL 313.64□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 219.76■□□□□ 0.752e-8■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-8■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-8■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-8■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 CTSD-209ENST00000637158 1200 ntTSL 520.4■□□□□ 0.861e-18■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 HMGA1-206ENST00000478214 716 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.356e-54■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 AC002094.3-201ENST00000555059 851 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.035e-8■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.295e-8■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 212.79□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.792e-49■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.13e-34■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.214e-6■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 20.4
PCBP1Q15365 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.836e-22■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.86e-22■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.326e-22■■■■□ 20.3
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