RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480991.1

SLC35E2B-201, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

TSL 2

Gene SLC35E2B, Length 2,860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-201ENST00000480991 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.35■■■□□ 2.29
SLC35E2B-201ENST00000480991 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35E2B-201ENST00000480991 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SLC35E2B-201ENST00000480991 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SLC35E2B-201ENST00000480991 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC35E2B-201ENST00000480991 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.7■■□□□ 1.54
SLC35E2B-201ENST00000480991 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC35E2B-201ENST00000480991 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC35E2B-201ENST00000480991 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.93■■□□□ 1.42
SLC35E2B-201ENST00000480991 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.68■■□□□ 1.38
SLC35E2B-201ENST00000480991 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.64■■□□□ 1.37
SLC35E2B-201ENST00000480991 HRCP23327 699 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC35E2B-201ENST00000480991 SCRIBQ14160 1630 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC35E2B-201ENST00000480991 ABCC9O60706 1549 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC35E2B-201ENST00000480991 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SLC35E2B-201ENST00000480991 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SLC35E2B-201ENST00000480991 TRIM41Q8WV44 630 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC35E2B-201ENST00000480991 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SLC35E2B-201ENST00000480991 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC35E2B-201ENST00000480991 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SLC35E2B-201ENST00000480991 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC35E2B-201ENST00000480991 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.02■■□□□ 1.28
SLC35E2B-201ENST00000480991 NACADO15069 1562 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC35E2B-201ENST00000480991 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.89■■□□□ 1.26
SLC35E2B-201ENST00000480991 WIZO95785 1651 aa22.77■■□□□ 1.23
SLC35E2B-201ENST00000480991 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SLC35E2B-201ENST00000480991 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SLC35E2B-201ENST00000480991 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SLC35E2B-201ENST00000480991 ABCC8Q09428 1581 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC35E2B-201ENST00000480991 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC35E2B-201ENST00000480991 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SLC35E2B-201ENST00000480991 SMARCA4P51532 1647 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC35E2B-201ENST00000480991 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SLC35E2B-201ENST00000480991 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.166e-6■■□□□ 12.8
SLC35E2B-201ENST00000480991 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SLC35E2B-201ENST00000480991 SMARCA2P51531 1590 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2B-201ENST00000480991 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC35E2B-201ENST00000480991 SOGA1O94964 1423 aa22.2■■□□□ 1.15
SLC35E2B-201ENST00000480991 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SLC35E2B-201ENST00000480991 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC35E2B-201ENST00000480991 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC35E2B-201ENST00000480991 CEP162Q5TB80 1403 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC35E2B-201ENST00000480991 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC35E2B-201ENST00000480991 TNIKQ9UKE5 1360 aa22■■□□□ 1.11
SLC35E2B-201ENST00000480991 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
SLC35E2B-201ENST00000480991 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC35E2B-201ENST00000480991 EEA1Q15075 1411 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC35E2B-201ENST00000480991 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SLC35E2B-201ENST00000480991 GOLGA3Q08378 1498 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC35E2B-201ENST00000480991 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SLC35E2B-201ENST00000480991 SYNJ1O43426 1573 aa21.78■■□□□ 1.08
SLC35E2B-201ENST00000480991 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.78■■□□□ 1.08
SLC35E2B-201ENST00000480991 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.77■■□□□ 1.08
SLC35E2B-201ENST00000480991 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SLC35E2B-201ENST00000480991 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SLC35E2B-201ENST00000480991 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SLC35E2B-201ENST00000480991 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC35E2B-201ENST00000480991 CLIP1P30622 1438 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC35E2B-201ENST00000480991 NEUROD1Q13562 356 aa21.64■■□□□ 1.05
SLC35E2B-201ENST00000480991 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.62■■□□□ 1.05
SLC35E2B-201ENST00000480991 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SLC35E2B-201ENST00000480991 KIF21BO75037 1637 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC35E2B-201ENST00000480991 APLP2Q06481 763 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC35E2B-201ENST00000480991 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC35E2B-201ENST00000480991 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC35E2B-201ENST00000480991 TOP2BQ02880 1626 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC35E2B-201ENST00000480991 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC35E2B-201ENST00000480991 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC35E2B-201ENST00000480991 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SLC35E2B-201ENST00000480991 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SLC35E2B-201ENST00000480991 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SLC35E2B-201ENST00000480991 PRXQ9BXM0 1461 aa21.31■■□□□ 1
SLC35E2B-201ENST00000480991 MIER1Q8N108 512 aa21.31■■□□□ 1
SLC35E2B-201ENST00000480991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.3■■□□□ 1
SLC35E2B-201ENST00000480991 NCAPD3P42695 1498 aa21.28■■□□□ 1
SLC35E2B-201ENST00000480991 CUX1P39880 1505 aa21.28■■□□□ 1
SLC35E2B-201ENST00000480991 ARAP1Q96P48 1450 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2B-201ENST00000480991 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.23■□□□□ 0.99
SLC35E2B-201ENST00000480991 KIF27Q86VH2 1401 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC35E2B-201ENST00000480991 HMGXB3Q12766 1538 aa21.2■□□□□ 0.99
SLC35E2B-201ENST00000480991 CFTRP13569 1480 aa21.16■□□□□ 0.98
SLC35E2B-201ENST00000480991 ITGAEP38570 1179 aa21.15■□□□□ 0.98
SLC35E2B-201ENST00000480991 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SLC35E2B-201ENST00000480991 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.08■□□□□ 0.97
SLC35E2B-201ENST00000480991 CUX2O14529 1486 aa21.05■□□□□ 0.96
SLC35E2B-201ENST00000480991 IGF1RP08069 1367 aa21.03■□□□□ 0.96
SLC35E2B-201ENST00000480991 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.03■□□□□ 0.96
SLC35E2B-201ENST00000480991 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SLC35E2B-201ENST00000480991 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.01■□□□□ 0.95
SLC35E2B-201ENST00000480991 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.96■□□□□ 0.95
SLC35E2B-201ENST00000480991 P3H3Q8IVL6 736 aa20.95■□□□□ 0.94
SLC35E2B-201ENST00000480991 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.94■□□□□ 0.94
SLC35E2B-201ENST00000480991 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SLC35E2B-201ENST00000480991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.91■□□□□ 0.94
SLC35E2B-201ENST00000480991 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC35E2B-201ENST00000480991 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SLC35E2B-201ENST00000480991 TIAM1Q13009 1591 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC35E2B-201ENST00000480991 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC35E2B-201ENST00000480991 PRDM2Q13029 1718 aa20.79■□□□□ 0.92
SLC35E2B-201ENST00000480991 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms