Protein–RNA interactions for Protein: Q15040

JOSD1, Josephin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JOSD1Q15040 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JOSD1Q15040 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JOSD1Q15040 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms