Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAT1Q14517 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT1Q14517 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms