Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms