Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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