Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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BNIP1Q12981 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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BNIP1Q12981 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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BNIP1Q12981 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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