Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms