Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms