Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDR2Q01850 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms