Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms