Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms