Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms