Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKD1P98161 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKD1P98161 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PKD1P98161 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PKD1P98161 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PKD1P98161 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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