Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX3P78415 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX3P78415 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms