Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB1P62873 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms