Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms