Protein–RNA interactions for Protein: P61236

YPEL3, Protein yippee-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL3P61236 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL3P61236 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms