Protein–RNA interactions for Protein: P61160

ACTR2, Actin-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR2P61160 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR2P61160 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR2P61160 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR2P61160 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR2P61160 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR2P61160 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR2P61160 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR2P61160 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR2P61160 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms