Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms