Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms