Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms