Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1GP51170 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms