Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGHMBP2P38935 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGHMBP2P38935 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGHMBP2P38935 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGHMBP2P38935 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGHMBP2P38935 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms