Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR1P36897 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms