Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms