Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC8A1P32418 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms