Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E2P29084 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms