Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms