Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GCSHP23434 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCSHP23434 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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