Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACO1P21399 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACO1P21399 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms