Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTF3P20783 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTF3P20783 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTF3P20783 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF3P20783 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF3P20783 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms